RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	UBE2C	O00762	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	LY6G6D	O95868	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		P01737	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TPPP2	P59282	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PSG3	Q16557	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		Q96MF0	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	BUB3	O43684	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	IGHG4	P01861	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TRGC2	P03986	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	AMY1A	P04745	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CXCL1	P09341	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PF4V1	P10720	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ID1	P41134	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		V9GYV3	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		G3V318	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		M0QZ24	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HOXA5	P20719	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	LY6E	Q16553	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		Q86TA4	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CR1	P17927	2039 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537		K7EN84	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	LGALS9	O00182	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	OVOL1	O14753	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	AKR1D1	P51857	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	CFHR3	Q02985	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	RIG	Q13278	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SF3A3-208	ENST00000489537	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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