RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.67□□□□□ -1.02
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C9orf3-220ENST00000489318 SMIM12Q96EX1 92 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-220ENST00000489318 FMC1Q96HJ9 113 aa8.67□□□□□ -1.02
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C9orf3-220ENST00000489318 IGLV2-8P01709 118 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-DMBP28068 263 aa8.65□□□□□ -1.02
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C9orf3-220ENST00000489318 LCN12Q6JVE5 192 aa8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 C16orf92Q96LL3 132 aa8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 K7EN84 100 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 M0R036 132 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 OCC1Q8TAD7 63 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 C20orf173Q96LM9 149 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 GCGP01275 180 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 BAGE2Q86Y30 109 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.61□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.61□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 SCO1O75880 301 aa8.6□□□□□ -1.03
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF738Q8NE65 137 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 SGK494Q96LW2 274 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 VGLL1Q99990 258 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF492Q9P255 531 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 CXorf65A6NEN9 183 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 MT-ND4LP03901 98 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-220ENST00000489318 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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