RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RBAKDNA6NC62 111 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 SMLR1H3BR10 107 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 K7EQM0 130 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 NMBP08949 121 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 STAG3L2P0CL84 134 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 STAG3L3P0CL85 134 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 MIFP14174 115 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 PPT1P50897 306 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RAB2AP61019 212 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 SLC51BQ86UW2 128 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 BLNKQ8WV28 456 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RAB24Q969Q5 203 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 FXYD5Q96DB9 178 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00477Q96M19 166 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RFNGQ9Y644 331 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM189A5PLL7 270 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 PYYP10082 97 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 LEPP41159 167 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 DEFB135Q30KP9 77 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RNF182Q8N6D2 247 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 C17orf77Q96MU5 243 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 RARRES2Q99969 163 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 OTORQ9NRC9 128 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf16-202ENST00000486420 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 INSP01308 110 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 OR10J4P0C629 311 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF124Q15973 351 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 TMED6Q8WW62 240 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NEU1Q99519 415 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 SLC17A3O00476 420 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NDUFB4O95168 129 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 CDKN1BP46527 198 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 RANP62826 216 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ICAM4Q14773 271 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 OR11H2Q8NH07 326 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 SUN5Q8TC36 379 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 C20orf173Q96LM9 149 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 TENM3Q9P273 2699 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1W2PRE2 83 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 GCHFRP30047 84 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 Q9H3A6 140 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 F6UZH7 168 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 C3orf84H3BNL1 204 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV3-20P01619 116 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 HBE1P02100 147 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 XCL2Q9UBD3 114 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 PGPA6NDG6 321 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 F6UB75 175 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 H3BTX0 84 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 FHITP49789 147 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 AMTNQ6UX39 209 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF503Q96F45 646 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 H7BYZ3 331 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF138P52744 262 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf16-202ENST00000486420 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms