RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 LYNX1P0DP58 116 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FGF6P10767 208 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 EVI2AP22794 236 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TGFAP01135 160 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM17P0DL12 118 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ORMDL3Q8N138 153 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FOXC2Q99958 501 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 RAB9BQ9NP90 201 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DYNLRB1Q9NP97 96 aa12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRBP23467 1997 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 Q86TA4 180 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HIGD1AQ9Y241 93 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB6E9PJ23 425 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PLGLAQ15195 96 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf77Q96MU5 243 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf69Q9H7B7 122 aa12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 AGRNO00468 2067 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HAX1O00165 279 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ADIPOQQ15848 244 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE13Q4V321 117 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS22Q9GZN4 317 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TPSG1Q9NRR2 321 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM189A5PLL7 270 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MLST8Q9BVC4 326 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LEPP41159 167 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS33Q8NF86 280 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf78Q9BR46 151 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CGB3P0DN86 165 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CGB7P0DN87 165 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGFL3Q6UXB1 125 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KLK15Q9H2R5 256 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFS7O75251 213 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 APOMO95445 188 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 COL12A1Q99715 3063 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf100A8MU93 164 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ORM1P02763 201 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf49Q96NF6 230 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PSG8Q9UQ74 426 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DCHS2Q6V1P9 2916 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 H3BVH4 76 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NPYP01303 97 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK8P0C7L1 97 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CT83Q5H943 113 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SYT8Q8NBV8 401 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA3O95167 84 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SVIPQ8NHG7 77 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF492Q9P255 531 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.84□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.84□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01560Q8TB33 94 aa12.84□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPI3 338 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FAM90A27PA6NNH2 459 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 THBDP07204 575 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RASL11BQ9BPW5 248 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KLF12Q9Y4X4 402 aa12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LY6HO94772 140 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 OR4C13Q8NGP0 309 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFB3O43676 98 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FCN3O75636 299 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MC5RP33032 325 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RITA1Q96K30 269 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms