RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PPQ1 181 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 FNDC10F2Z333 226 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BTX0 84 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A3O00476 420 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RLN2P04090 185 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TEPPQ6URK8 271 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf170A2RU37 121 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BNG1 76 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GOSR2O14653 212 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLC2P0DOY2 106 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00315P59091 139 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 MORN5Q5VZ52 161 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZTI0 123 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF546Q86UE3 836 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC190Q86UF4 302 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF24Q9Y225 148 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SNURFLB1AK76 121 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BQ15 152 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 J3KRW8 73 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 COX7A2P2O60397 106 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A10P0DMU9 189 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL16Q0P5N6 197 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 OPCMLQ14982 345 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 MGST2Q99735 147 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A096LPF7 62 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 AGPAT2O15120 278 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TSC22D2O75157 780 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFB6O95139 128 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB1D2O95969 90 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 LEPP41159 167 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R30P59541 319 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ODF3Q96PU9 254 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA5P01569 189 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4E1P0C645 316 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 C4orf46Q504U0 113 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 GGACTQ9BVM4 153 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf66A4D0T2 115 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NXPH4O95158 308 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A5P33763 92 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CAMLGP49069 296 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SRRQ9GZT4 340 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf71A4D174 169 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 KLLNB2CW77 178 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R3E3 92 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SIVA1O15304 175 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CD300CQ08708 224 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ERCC8Q13216 396 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 GUK1Q16774 197 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 MIC13Q5XKP0 118 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIQKQ629K1 86 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 FUT9Q9Y231 359 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 EREGO14944 169 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 PAX4O43316 350 aa6.41□□□□□ -1.38
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