RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 FXYD5Q96DB9 178 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 ZNF503Q96F45 646 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 PAXXQ9BUH6 204 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 ZNF266Q14584 549 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 BAP18Q8IXM2 172 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 RNF141Q8WVD5 230 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-211ENST00000480301 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 M0R3E3 92 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 INSP01308 110 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 OR10J4P0C629 311 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 CELA1Q9UNI1 258 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 M6PRP20645 277 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 PRELID1Q9Y255 219 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 RYR2Q92736 4967 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 OR7C2O60412 319 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -06e-9■■■□□ 16.1
ACTB-211ENST00000480301 CDKN1BP46527 198 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 RAB2AP61019 212 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 LYSTQ99698 3801 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 TMEM189A5PLL7 270 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 HBE1P02100 147 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 CT45A10P0DMU9 189 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0CP27449 155 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 ICAM4Q14773 271 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 KIR3DS1Q14943 382 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 RRN3P1Q2M238 152 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-211ENST00000480301 PRM2P04554 102 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 EMP1P54849 157 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R45P59539 299 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 C12orf74Q32Q52 190 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 KHDC3LQ587J8 217 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 SMLR1H3BR10 107 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 JTBO76095 146 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ERCC8Q13216 396 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM122CQ6P4D5 195 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZTC4 211 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 OR10G4Q8NGN3 311 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 OR10G9Q8NGN4 311 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 OR10G7Q8NGN6 311 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPV4 95 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 TSPOP30536 169 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ODF3Q96PU9 254 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 C11orf94C9JXX5 98 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 RANP62826 216 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 LINC01587Q99440 93 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 DKK2Q9UBU2 259 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ARPC5O15511 151 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 AZU1P20160 251 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 LEPP41159 167 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 SERF2P84101 59 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 LINC00477Q96M19 166 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 Q9H3A6 140 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R60P59551 318 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 VGLL1Q99990 258 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-211ENST00000480301 J3KRW8 73 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms