RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 DEFB4AO15263 64 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 FXYD7P58549 80 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 RRN3P1Q2M238 152 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 KHDC3LQ587J8 217 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 ODF3Q96PU9 254 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PPV4 95 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SLC17A3O00476 420 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 M6PRP20645 277 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 PAXXQ9BUH6 204 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 M0R2Z0 102 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 OR7C2O60412 319 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 MBP02144 154 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DMBP28068 263 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SERF2P84101 59 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 RNF141Q8WVD5 230 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 LINC00477Q96M19 166 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 PYYP10082 97 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 LEPP41159 167 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 CSN1S1P47710 185 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 BLNKQ8WV28 456 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 H3BTX0 84 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 H7BYZ3 331 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 TAAR5O14804 337 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB4O95168 129 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 NMBP08949 121 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R60P59551 318 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 WFDC1Q9HC57 220 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-211ENST00000476336 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LYRM9A8MSI8 78 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ICAM4Q14773 271 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 FXYD5Q96DB9 178 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LINC01587Q99440 93 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 DKK2Q9UBU2 259 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RBAKDNA6NC62 111 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 PRAC2D3DTV9 90 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 OR10J4P0C629 311 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZTC4 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 BAP18Q8IXM2 172 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 C16orf74Q96GX8 76 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 FAM210BQ96KR6 192 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 M0R3E3 92 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 EMP1P54849 157 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 C12orf74Q32Q52 190 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 Q5BKY6 102 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 CELA1Q9UNI1 258 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RNF222A6NCQ9 220 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 IGLL5B9A064 214 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 CT45A10P0DMU9 189 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ATP6V0CP27449 155 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms