RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 Q9HAA7 133 aa9.54□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.54□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 CXCL2P19875 107 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 ASIPP42127 132 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF415Q09FC8 603 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 NEDD8Q15843 81 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 RAB26Q9ULW5 256 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.53□□□□□ -0.88
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.52□□□□□ -0.89
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RALGPS1-211ENST00000471643 H3BTX0 84 aa9.52□□□□□ -0.89
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RALGPS1-211ENST00000471643 OR5G3P0C626 314 aa9.52□□□□□ -0.89
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RALGPS1-211ENST00000471643 RS1O15537 224 aa9.51□□□□□ -0.89
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RALGPS1-211ENST00000471643 Q6ZQT7 251 aa9.5□□□□□ -0.89
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RALGPS1-211ENST00000471643 FAM25CB3EWG5 89 aa9.46□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM25GB3EWG6 89 aa9.46□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 TIRAPP58753 221 aa9.46□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.46□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 PRR9Q5T870 116 aa9.46□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.46□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 SMCO3A2RU48 225 aa9.45□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.45□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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RALGPS1-211ENST00000471643 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 TM2D2Q9BX73 214 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.43□□□□□ -0.9
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