RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		H3BP45	60 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		H3BTX0	84 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ANXA3	P12429	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	EVI2A	P22794	236 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	LEP	P41159	167 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	AP3S1	Q92572	193 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	C8orf49	Q96NF6	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC25A6	P12236	298 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	C1QB	P02746	253 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	CRYGD	P07320	174 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SELENOT	P62341	195 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	FHL2	Q14192	279 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		Q8N814	137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A087WXM4	84 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	TCL1A	P56279	114 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SLA	Q13239	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	PSCA	O43653	123 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		Q6ZSA8	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	C7orf71	A4D174	169 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996		K7EQD1	137 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CD300C	Q08708	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	VGLL1	Q99990	258 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996		E5RGE8	158 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996		H3BQ15	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CTDSP2	O14595	271 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996		K7EPK0	472 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CTDSPL	O15194	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CCNK	O75909	580 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	KLLN	B2CW77	178 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RGS5	O15539	181 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	OXT	P01178	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	SRI	P30626	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	ERCC8	Q13216	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CTF1	Q16619	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	HOXB5	P09067	269 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	GYPE	P15421	78 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	IL18	Q14116	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	OPCML	Q14982	345 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996		Q6ZQT7	251 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	MPDU1	O75352	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	VAMP1	P23763	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF415	Q09FC8	603 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	GOSR2	O14653	212 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	ID3	Q02535	119 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPN18-208	ENST00000462996		M0R3E3	92 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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