RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PPV4 95 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 TAAR5O14804 337 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 JTBO76095 146 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 KHDC3LQ587J8 217 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 PAXXQ9BUH6 204 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR51M1Q9H341 326 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 LYSTQ99698 3801 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 SMLR1H3BR10 107 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR7C2O60412 319 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 INSP01308 110 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 BLNKQ8WV28 456 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.94□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 PRAC2D3DTV9 90 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 MBP02144 154 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 ATP6V0CP27449 155 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 SERF2P84101 59 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 BAP18Q8IXM2 172 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 CELA1Q9UNI1 258 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 PRELID1Q9Y255 219 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RFNGQ9Y644 331 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RYR2Q92736 4967 aa14.93□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 NDUFB4O95168 129 aa14.92□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 HBE1P02100 147 aa14.92□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.92□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RNF141Q8WVD5 230 aa14.92□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 TMEM189A5PLL7 270 aa14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RAB2AP61019 212 aa14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 Q6ZNX1 250 aa14.91□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 HMSDA8MTL9 139 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 OR10J4P0C629 311 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 EMP1P54849 157 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 ZNF345Q14585 488 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 RRN3P1Q2M238 152 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 FXYD5Q96DB9 178 aa14.9□□□□□ -0.02
VARS-218ENST00000459667 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 C11orf94C9JXX5 98 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 M0R3E3 92 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 CDKN1BP46527 198 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 Q6ZTC4 211 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.89□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 A0A0D9SG52 128 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 TSPOP30536 169 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ICAM4Q14773 271 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 C12orf74Q32Q52 190 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ZNF503Q96F45 646 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 CT45A10P0DMU9 189 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 CSN1S1P47710 185 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ODF3Q96PU9 254 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 LINC01587Q99440 93 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 LEPP41159 167 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 RANP62826 216 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 ERCC8Q13216 396 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 KIR3DS1Q14943 382 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-218ENST00000459667 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms