RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ID1P41134 155 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 CD5LO43866 347 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 LHBP01229 141 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 SLC25A16P16260 332 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ST20Q9HBF5 79 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 MGAQ8IWI9 3026 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 A0A1B0GW15 77 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 M0R1W7 72 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 PEX7O00628 323 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 CR1LQ2VPA4 569 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 C19orf84I3L1E1 186 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 GLMPQ8WWB7 406 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 MGPP08493 103 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 FA2HQ7L5A8 372 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 A0A1W2PPI3 338 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 A8MWL6 223 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 G3V4G9 280 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 DEFB125Q8N687 156 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 RNF125Q96EQ8 232 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 PRORYQ9H606 182 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 HCFC1P51610 2035 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 G3V318 75 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 HLA-DRB1P01911 266 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 NACAE9PAV3 2078 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 WT1-ASQ06250 92 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ADAMTS20P59510 1910 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV4-39P01824 125 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 A0A1W2PRE2 83 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 IGLC1P0CG04 106 aa8.47□□□□□ -1.05
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TOP3B-210ENST00000444502 Q0VG73 95 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 KIR3DS1Q14943 382 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 COX19Q49B96 90 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 CTRLP40313 264 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 A0A1B0GWB2 263 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 ETDBQ3ZM63 59 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TCF24Q7RTU0 167 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 Q9H3A6 140 aa8.46□□□□□ -1.05
TOP3B-210ENST00000444502 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 SFTA2Q6UW10 78 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 PSG3Q16557 428 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 ASCL2Q99929 193 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 PSMB11A5LHX3 300 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 UBE2E1P51965 193 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF138P52744 262 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM189A5PLL7 270 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV1-69P01742 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 B5MCH6 92 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 DDB2Q92466 427 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 EPDR1Q9UM22 224 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF292O60281 2723 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 HIGD1CA8MV81 97 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 HERV-K104P63124 156 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3B-210ENST00000444502 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.44□□□□□ -1.06
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