RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 IGLC2P0DOY2 106 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 BAXQ07812 192 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 FCN2Q15485 313 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 ATP6V1FQ16864 119 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 H3BQ15 152 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 SLC17A3O00476 420 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 NUDT3O95989 172 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 CCL18P55774 89 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 VWC2Q2TAL6 325 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 MORN5Q5VZ52 161 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 ZNF253O75346 499 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 MPDU1O75352 247 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 LEPP41159 167 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 RAB32Q13637 225 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 ODF3Q96PU9 254 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 SNURFLB1AK76 121 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 PRAC2D3DTV9 90 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 RLN2P04090 185 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 FGF7P21781 194 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 CLINT1Q14677 625 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 S100ZQ8WXG8 99 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 IGSF23A1L1A6 192 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 MED14OSP0DP75 135 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 IL15RAQ13261 267 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 PRELID1Q9Y255 219 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 J3KRW8 73 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 CT45A10P0DMU9 189 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ASAH1Q13510 395 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 OR5I1Q13606 314 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 PDE6HQ13956 83 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 KIR3DS1Q14943 382 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ENKURQ8TC29 256 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 RNF141Q8WVD5 230 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 M6PRP20645 277 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ZNF503Q96F45 646 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 LINC00477Q96M19 166 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 DNAH2Q9P225 4427 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GAGE12BA1L429 117 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 E5RGE8 158 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GAGE7O76087 117 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GAGE12FP0CL80 117 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GAGE12GP0CL81 117 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 GAGE12IP0CL82 117 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 BLNKQ8WV28 456 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 C7orf71A4D174 169 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 M0R3E3 92 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 PRAF2O60831 178 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NHLH2Q02577 135 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 SSX7Q7RTT5 188 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 C6orf223Q8N319 242 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NMES1Q9C002 83 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 NACAE9PAV3 2078 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-206ENST00000431413 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.58□□□□□ -0.72
HERC3-206ENST00000431413 H3BNG1 76 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms