RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431099.3

CBWD1-208, Transcript of COBW domain containing 1, human

TSL 5

Gene CBWD1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD1-208	ENST00000431099	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		H3BRN7	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DEFB4A	O15263	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SSSCA1	O60232	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ADAP1	O75689	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HBE1	P02100	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ORM2	P19652	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	BTC	P35070	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR2F1	Q13607	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		Q6ZTC4	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		H3BP45	60 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	GOSR2	O14653	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LYRM1	O43325	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	INS	P01308	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PRSS2	P07478	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LINC00869	P0C866	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HBG1	P69891	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HBG2	P69892	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	GUK1	Q16774	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RNF212	Q495C1	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PLA2G10	O15496	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PAGE4	O60829	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF253	O75346	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	MPDU1	O75352	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TCRB	P04435	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	OR5G3	P0C626	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CXCL3	P19876	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	S100A11	P31949	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		Q6ZRG5	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PFDN5	Q99471	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		L7N2F9	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	AGPAT2	O15120	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CDKN1B	P46527	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TAS2R60	P59551	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PDE6H	Q13956	83 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PSG3	Q16557	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	STX12	Q86Y82	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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