RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CSN3P07498 182 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 IGLC6P0CF74 106 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 APELAP0DMC3 54 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PRTN3P24158 256 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PCP4P48539 62 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 HSD52Q0P140 79 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MUC21Q5SSG8 566 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.21□□□□□ -0.29
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087X0K7 114 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 RBAKDNA6NC62 111 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 D6R8Y8 96 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 CD24P25063 80 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 PAX8Q06710 450 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ARPC1AQ92747 370 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 PRR25Q96S07 402 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 RABAC1Q9UI14 185 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 RAXQ9Y2V3 346 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 A0A096LNJ9 63 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 FGF6P10767 208 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF138P52744 262 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 C17orf77Q96MU5 243 aa13.2□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 H3BRM9 83 aa13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 UCNP55089 124 aa13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 Q8N6K4 173 aa13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DRB4P13762 266 aa13.18□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 SMPXQ9UHP9 88 aa13.18□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.18□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 PLXNB1O43157 2135 aa13.18□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 K7ENP7 123 aa13.17□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.17□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf49Q96NF6 230 aa13.17□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 MAP1LC3AQ9H492 121 aa13.17□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.17□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 F8W735 103 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 M0R3E3 92 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6V0BQ99437 205 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 HIF1ANQ9NWT6 349 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.16□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 A1L4Q6 167 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 C7orf71A4D174 169 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 K7ERU9 68 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 CKS2P33552 79 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 CST9LQ9H4G1 147 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 HIGD1BQ9P298 99 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 OR2T8A6NH00 312 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZVH6 145 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 AMN1Q8IY45 258 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 AP1S3Q96PC3 154 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 ASCL2Q99929 193 aa13.15□□□□□ -0.3
HCLS1-202ENST00000428394 C9orf118A6NHY6 69 aa13.14□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.14□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.14□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 TPPP3Q9BW30 176 aa13.14□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM213A2RRL7 107 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 PRSS47A8MTI9 375 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 NCR2O95944 276 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.13□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 H0Y8G0 127 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 FCER1GP30273 86 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 CACNG7P62955 275 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 TWIST1Q15672 202 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 ZMAT4Q9H898 229 aa13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 ATP5LO75964 103 aa13.11□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 CTSGP08311 255 aa13.11□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 COTL1Q14019 142 aa13.11□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 HES1Q14469 280 aa13.11□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 KIR3DS1Q14943 382 aa13.11□□□□□ -0.31
HCLS1-202ENST00000428394 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms