RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 PAX9P55771 341 aa11.72□□□□□ -0.53
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF492Q9P255 531 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRU-204ENST00000428026 F8WEM9 126 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1-39P01597 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1D-39P04432 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 AZU1P20160 251 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 LY6HO94772 140 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA1671Q9BY89 1806 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 J3QKU1 62 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-204ENST00000428026 WISP1O95388 367 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
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