RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 OSTCQ9NRP0 149 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 COLCA2A8K830 154 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01619G3V211 115 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 CHEK1O14757 476 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 LTAP01374 205 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 S100PP25815 95 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 PSG3Q16557 428 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01006Q8NI28 216 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 C17orf77Q96MU5 243 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 MLST8Q9BVC4 326 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 PEMTQ9UBM1 199 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-202ENST00000409024 M0QZ24 198 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SLC17A3O00476 420 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV2-8P01709 118 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FOLR2P14207 255 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 GNG5P63218 68 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FOXL1Q12952 345 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 DPF1Q92782 380 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 YPEL4Q96NS1 127 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF492Q9P255 531 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 MLXQ9UH92 298 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WW49 117 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 H3BTX0 84 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 K7EN84 100 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ELOBQ15370 118 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 LCN12Q6JVE5 192 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 NRN1Q9NPD7 142 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PSG8Q9UQ74 426 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM213A2RRL7 107 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV2-11P01706 119 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ID1P41134 155 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ERVFC1-1P60608 527 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 DEFA6Q01524 100 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TM4SF20Q53R12 229 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 CT83Q5H943 113 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 Q86TA4 180 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C16orf92Q96LL3 132 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00479Q96M42 142 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 RNF114Q9Y508 228 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf70A6NJV1 201 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SOCS3O14543 225 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OVOL1O14753 267 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 CBLN1P23435 193 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SYNJ2BPP57105 145 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PROK1P58294 105 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PAFAH1B2P68402 229 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OR11H1Q8NG94 326 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00477Q96M19 166 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IL36BQ9NZH7 164 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.42□□□□□ -1.22
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