RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.92□□□□□ -1.14
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HERC3-202ENST00000402738 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.91□□□□□ -1.14
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HERC3-202ENST00000402738 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.91□□□□□ -1.14
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HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.91□□□□□ -1.14
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HERC3-202ENST00000402738 RS1O15537 224 aa7.89□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.89□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.88□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.88□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 SIP14410 1827 aa7.87□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
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HERC3-202ENST00000402738 A0A087WX48 190 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 VWC2LB2RUY7 222 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-19P01714 112 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 SOCS3O14543 225 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 DTX2Q86UW9 622 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-202ENST00000402738 C1orf159Q96HA4 380 aa7.86□□□□□ -1.15
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