RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4BPBP20851 252 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DMBP28068 263 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB1P60022 68 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFNGQ9Y644 331 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QBP02746 253 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLNKQ8WV28 456 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF503Q96F45 646 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HYLS1Q96M11 299 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RARRES2Q99969 163 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV3-20P01619 116 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10J4P0C629 311 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAG3L2P0CL84 134 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAG3L3P0CL85 134 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMTNQ6UX39 209 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR11H2Q8NH07 326 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB24Q969Q5 203 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PFDN1O60925 122 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL17DQ8TAD2 202 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XCL2Q9UBD3 114 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC11BP0C7V7 166 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIFP14174 115 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMUB2Q71RG4 321 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ODF3Q96PU9 254 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UMAD1C9J7I0 102 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXorf1O96002 111 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSN1S1P47710 185 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ICAM4Q14773 271 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STOML3Q8TAV4 291 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUN5Q8TC36 379 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEU1Q99519 415 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R3E3 92 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPOP30536 169 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANP62826 216 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAP18Q8IXM2 172 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00477Q96M19 166 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9H3A6 140 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTORQ9NRC9 128 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAC2D3DTV9 90 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C3orf84H3BNL1 204 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INSP01308 110 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCHFRP30047 84 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDKN1BP46527 198 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC7Q8TAX7 377 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 X6R8D5 127 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YWU9 116 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBAKDNA6NC62 111 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FXYD7P58549 80 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP69Q49AA0 526 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8NAQ8 132 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGP01266 2768 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R2Z0 102 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMBP08949 121 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEPP41159 167 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF726P1Q15940 193 aa11.08□□□□□ -0.64
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