RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD5Q96DB9 178 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf84H3BNL1 204 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFB4O95168 129 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 PFDN1O60925 122 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 MIFP14174 115 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPOP30536 169 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD7P58549 80 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.2□□□□□ -0.62
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PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP14Q86UN6 197 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0J9YWU9 116 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 CSN1S1P47710 185 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ICAM4Q14773 271 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB24Q969Q5 203 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF503Q96F45 646 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL2L11O43521 198 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 INSP01308 110 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 RANP62826 216 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 NEU1Q99519 415 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAC2D3DTV9 90 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R3E3 92 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 CXorf1O96002 111 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 STAG3L2P0CL84 134 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 STAG3L3P0CL85 134 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMUB2Q71RG4 321 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 HYLS1Q96M11 299 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00477Q96M19 166 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ODF3Q96PU9 254 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 OTORQ9NRC9 128 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.16□□□□□ -0.62
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1QBP02746 253 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC11BP0C7V7 166 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 LEPP41159 167 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN1BP46527 198 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 Q9H3A6 140 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 X6R8D5 127 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM189A5PLL7 270 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 UMAD1C9J7I0 102 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 HBE1P02100 147 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 GCHFRP30047 84 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8NAQ8 132 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1B-202ENST00000379615 PGPA6NDG6 321 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 BAP18Q8IXM2 172 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 STOML3Q8TAV4 291 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 RBAKDNA6NC62 111 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB4AO15263 64 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A10P0DMU9 189 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 RRN3P1Q2M238 152 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 SUN5Q8TC36 379 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 NMBP08949 121 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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