RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 RNF7Q9UBF6 113 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ATMQ13315 3056 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y8G0 127 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SAP30O75446 220 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 CRYGCP07315 174 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GP9P14770 177 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 EDN2P20800 178 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS7P47929 136 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF137PP52743 207 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GNG5P63218 68 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TAL2Q16559 108 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 MORN5Q5VZ52 161 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ERASQ7Z444 233 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SPTA1P02549 2419 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1-16P04430 117 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ORM2P19652 201 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 S100A7P31151 101 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GLRXP35754 106 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SLURP1P55000 103 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 RIPPLY3P57055 190 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00311Q8N616 119 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 U3KQK5 164 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 UQCRFS1P47985 274 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 FAM27E3Q08E93 113 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 THYN1Q9P016 225 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 DYSFO75923 2080 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LAMA5O15230 3695 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 M0R1B8 84 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 CSN3P07498 182 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 WT1-ASQ06250 92 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 SYT8Q8NBV8 401 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 PRELID3AQ96N28 172 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 VGLL1Q99990 258 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 VCX2Q9H322 139 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ITPR1Q14643 2758 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 POLEQ07864 2286 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5LO75964 103 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-7P01780 117 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TFF1P04155 84 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 MYOD1P15172 320 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 PDE6HQ13956 83 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 PRNTQ86SH4 94 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LEAP2Q969E1 77 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V0BQ99437 205 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG7P62955 275 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TWIST1Q15672 202 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 NUP37Q8NFH4 326 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GAFA1Q96PS6 74 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TM2D2Q9BX73 214 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf100A8MU93 164 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF1AP19438 455 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 NMUP48645 174 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF138P52744 262 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01546A6NGU7 62 aa5.66□□□□□ -1.5
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