RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 NACAE9PAV3 2078 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 H3BRN7 92 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 M0QZ24 198 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 TAS2R60P59551 318 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 EBI3Q14213 229 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 PIFOQ8TCI5 191 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 CCDC140Q96MF4 163 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 C8orf49Q96NF6 230 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 A8MWL6 223 aa9.02□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.02□□□□□ -0.96
HPS1-204ENST00000361490 ATRQ13535 2644 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PSG9Q00887 426 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 LCN12Q6JVE5 192 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 VGLL1Q99990 258 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TMEM189A5PLL7 270 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 A6NDX4 124 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 F6UB75 175 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 ZNF688P0C7X2 276 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 SRIP30626 198 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 C9JCJ5 164 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 FMC1Q96HJ9 113 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 AJUBAQ96IF1 538 aa9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 VPS13CQ709C8 3753 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 A0A1W2PS18 150 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 SPRY2O43597 315 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 APCSP02743 223 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 MEGF9Q9H1U4 602 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 IGHG2P01859 326 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 KRTDAPP60985 99 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TMEM183BQ1AE95 376 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TMEM242Q9NWH2 141 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PRAC2D3DTV9 90 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 J3QLI3 93 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PHOX2AO14813 284 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 HSBP1O75506 76 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 AMTP48728 403 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TWIST1Q15672 202 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 C11orf52Q96A22 123 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 OSTCQ9NRP0 149 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 V9GYV3 84 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 TENM4Q6N022 2769 aa8.99□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 Q86TA4 180 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.99□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 GPX1P07203 203 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 IQCJQ1A5X6 159 aa8.98□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 NUP35Q8NFH5 326 aa8.98□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 F8W735 103 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 USMG5Q96IX5 58 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PSMG4Q5JS54 123 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.98□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.97□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 PRO1933Q9H354 126 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 FXYD7P58549 80 aa8.97□□□□□ -0.97
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HPS1-204ENST00000361490 CD99P14209 185 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 MEOX2P50222 304 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 PLP1P60201 277 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 S100A12P80511 92 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 OR11H1Q8NG94 326 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 FOXL1Q12952 345 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 WDR73Q6P4I2 378 aa8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
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