RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP250Q9BV73 2442 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASIPP42127 132 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 MOB3BQ86TA1 216 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNA1GO43497 2377 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 ROS1P08922 2347 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01549A6NIU2 74 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 FCGR3BO75015 233 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf159Q96HA4 380 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 NABP2Q9BQ15 211 aa8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAALCQ8WXS3 180 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 COQ2Q96H96 371 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QLI3 93 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 PF4P02776 101 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXC1Q12948 553 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00477Q96M19 166 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFS7O75251 213 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TCL1BO95988 128 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD7P09564 240 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ORM2P19652 201 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR9G1Q8NH87 305 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRAPQ8TCY5 172 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ODF3Q96PU9 254 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.58□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMD4Q96H15 378 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM201AQ5SY85 155 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00596Q86U02 117 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CALYQ9NYX4 217 aa8.57□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGAQ8IWI9 3026 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBAKDNA6NC62 111 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 P01737 135 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNCP24821 2201 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PROP1O75360 226 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 HBDP02042 147 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CECR9P0C854 216 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 P0C879 139 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXF2Q12947 444 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUX3Q96PT4 197 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNG12Q9UBI6 72 aa8.56□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GX51 115 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-2P23083 117 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6DQ14210 128 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATMQ13315 3056 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEX7O00628 323 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS1P07477 247 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.55□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C15orf65H3BRN8 121 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAL2Q16559 108 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKCP01834 107 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM219Q86XT9 240 aa8.54□□□□□ -1.04
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