RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 I3L3M4 83 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 STPG4Q8N801 248 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LIME1Q9H400 295 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 WBP1Q96G27 269 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CCL4P13236 92 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5J2P56134 94 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF114Q8NC26 417 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TIMM23O14925 209 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PCOLCEQ15113 449 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C15orf32Q32M92 178 aa6.75□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WX48 190 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 GAS1P54826 345 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C20orf78Q9BR46 151 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PR77 199 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 NRTNQ99748 197 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LINC01565O15544 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 RCHY1Q96PM5 261 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.74□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 F6UB75 175 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 BSPH1Q075Z2 132 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LILRA1O75019 489 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CRLF1O75462 422 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGLL1P15814 213 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PSG7Q13046 419 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-5P01602 117 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHG2P01859 326 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF876PQ49A33 203 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 QRFPP83859 136 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SPXQ9BT56 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PPI3 338 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C17orf100A8MU93 164 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CCL25O15444 150 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 MST1LQ2TV78 715 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 HERVK_113P63121 156 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CRYBA4P53673 196 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 SRRM5B3KS81 715 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 V9GYV3 84 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 COX6B1P14854 86 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 HIGD1BQ9P298 99 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C15orf62A8K5M9 175 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 FOXC1Q12948 553 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LY6EQ16553 131 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.72□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-23P01764 117 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf47Q569G3 176 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 DSCAMO60469 2012 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 RHOHQ15669 191 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 TECTAO75443 2155 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 CRYGSP22914 178 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 DEFB124Q8NES8 71 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf52Q96A22 123 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 C1orf159Q96HA4 380 aa6.71□□□□□ -1.33
PKHD1-201ENST00000340994 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 C12orf74Q32Q52 190 aa6.71□□□□□ -1.34
PKHD1-201ENST00000340994 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.71□□□□□ -1.34
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