RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 HLA-DMBP28068 263 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 TMEM18Q96B42 140 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PRR25Q96S07 402 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 GNB4Q9HAV0 340 aa8.68□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 RBAKDNA6NC62 111 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 RNF223E7ERA6 249 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 F2Z2F3 143 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 TGFAP01135 160 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 TRBV12-3P01733 135 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 IGHV4-59P01825 116 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 GZMBP10144 247 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 CSN1S1P47710 185 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 LCN12Q6JVE5 192 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 GLMPQ8WWB7 406 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.67□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 HAX1O00165 279 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 NDUFA4O00483 81 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 APCSP02743 223 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 Q6YL49 198 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 OR5R1Q8NH85 324 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 C8orf49Q96NF6 230 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 METTL26Q96S19 204 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 VGLL1Q99990 258 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 TMEM89A2RUT3 159 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PRAC2D3DTV9 90 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 SERF1AO75920 110 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 ARL3P36405 182 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 TPPP2P59282 170 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 RAB4BP61018 213 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PAFAH1B2P68402 229 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 ASCL2Q99929 193 aa8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 LRRK2Q5S007 2527 aa8.65□□□□□ -1.02
PGA3-201ENST00000325558 PSMB8P28062 276 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 HBBP68871 147 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 GPHB5Q86YW7 130 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 PTPN13Q12923 2485 aa8.65□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SOCS3O14543 225 aa8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SRIP30626 198 aa8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 CHD6Q8TD26 2715 aa8.64□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 A0A0G2JLM5 398 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 GPX1P07203 203 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 FAM209BQ5JX69 171 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 Q5PR19 223 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 A0A1W2PS18 150 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SH2D1AO60880 128 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZWC4 215 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 RCHY1Q96PM5 261 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.63□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 K7EMT4 169 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 PF4V1P10720 104 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 CAMPP49913 170 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 Q6AWC8 147 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.61□□□□□ -1.03
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