RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LY6HO94772 140 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 GNLYP22749 145 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 OVOL2Q9BRP0 275 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 RLFQ13129 1914 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 NPC2P61916 151 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 ZNRD1Q9P1U0 126 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRDP23468 1912 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00311Q8N616 119 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 COX11Q9Y6N1 276 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WWL8 130 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12BA1L429 117 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 CYYR1Q96J86 154 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS8O00217 210 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 EREGO14944 169 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM213A2RRL7 107 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 WDR86Q86TI4 376 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 CFHR2P36980 270 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf58Q2M2W7 97 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 WISP1O95388 367 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 Q5PR19 223 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 STPG4Q8N801 248 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0E1O15342 81 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LEPROTO15243 131 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYV3 84 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-53P01767 116 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA4P78363 2273 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 RHODO00212 210 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF524Q96C55 264 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 GATA3P23771 443 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N8P6 123 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUS0 222 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-1P01715 115 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LURAP1LQ8IV03 231 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf52Q96A22 123 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 SPXQ9BT56 116 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf65H3BRN8 121 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 LOXP28300 417 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 U3KQA8 63 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SYNJ2BPP57105 145 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 USF3Q68DE3 2245 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV2-5P01817 119 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM141Q96I45 108 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-44P01699 117 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf49Q96NF6 230 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGLC2P0DOY2 106 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGLC3P0DOY3 106 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB131AP59861 70 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 WT1-ASQ06250 92 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 OCIAD2Q56VL3 154 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 PRR25Q96S07 402 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IL15RAQ13261 267 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 MSMBP08118 114 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SNHG12Q9BXW3 62 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 H3BRN7 92 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SLAQ13239 276 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 POU2AF1Q16633 256 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZWC4 215 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR5AQ86XA9 2040 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.9■□□□□ 0.3
CCSAP-201ENST00000284617 DKK1O94907 266 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.4 ms