RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 CDK2AP2O75956 126 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 LIME1Q9H400 295 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 CLPSP04118 112 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.22□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 A0A1W2PPM0 123 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 TRGV9Q99603 122 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 RASL10AQ92737 203 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 CEND1Q8N111 149 aa10.21□□□□□ -0.77
RIMS1-201ENST00000264839 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 COL8A2P25067 703 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 Q0VFX4 171 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PMVKQ15126 192 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 WDR81Q562E7 1941 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GAGE12JA6NER3 117 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GAGE4Q13068 117 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GAGE5Q13069 117 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GAFA1Q96PS6 74 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 ARTNQ5T4W7 220 aa10.21□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 H3BUX3 64 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 LHBP01229 141 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 K7EP34 96 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GTF3C1Q12789 2109 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PAX9P55771 341 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 LYL1P12980 280 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM126AQ9H061 195 aa10.2□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 FAM166AQ6J272 317 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 XCL2Q9UBD3 114 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 TRACP01848 142 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM178BH3BS89 294 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 IGHV2-5P01817 119 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 A0A1W2PPI3 338 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C17orf77Q96MU5 243 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 Q0VG73 95 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PCP2Q8IVA1 136 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 V9GYV3 84 aa10.19□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 HLA-DMBP28068 263 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 CRYBA4P53673 196 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 COL4A6Q14031 1691 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C5orf47Q569G3 176 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SIPA1L1O43166 1804 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SRRM5B3KS81 715 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 K7EN84 100 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 NUPR1O60356 82 aa10.18□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 CACNA1EQ15878 2313 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PSCAO43653 123 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 NPYP01303 97 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 OVOL3O00110 214 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 CARD19Q96LW7 228 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 COX8AP10176 69 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.17□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 G3V318 75 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 DEFB131AP59861 70 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GAGE6Q13070 117 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 UCNP55089 124 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 SOCS3O14543 225 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 WNK2Q9Y3S1 2297 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF524Q96C55 264 aa10.16□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.15□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.15□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RIMS1-201ENST00000264839 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms