RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF785A8K8V0 405 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EMT4 169 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QZ24 198 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG3L2P0CL84 134 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG3L3P0CL85 134 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 GCHFRP30047 84 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCA2BQ16661 112 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 HAGHQ16775 308 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF182Q8N6D2 247 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PAXXQ9BUH6 204 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51M1Q9H341 326 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 UMAD1C9J7I0 102 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R3E3 92 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB4O95168 129 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNA7P01567 189 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MBP02144 154 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLC2P0DOY2 106 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5G3P48201 142 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG5P63218 68 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 KHDC3LQ587J8 217 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF141Q8WVD5 230 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SGK494Q96LW2 274 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RARRES2Q99969 163 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG13Q9P2W3 67 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PEMTQ9UBM1 199 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 JMJD1CQ15652 2540 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAC2D3DTV9 90 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 F6UB75 175 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 G3V4G9 280 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS13O14921 159 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PAGE4O60829 102 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf1O96002 111 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF688P0C7X2 276 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RANP62826 216 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ICAM4Q14773 271 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00052Q96N35 136 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9H3A6 140 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PS18 150 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PGPA6NDG6 321 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 KNCNA6PVL3 124 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GGTLC3B5MD39 225 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 C9JQL5 133 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EQG2 157 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SOCS3O14543 225 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV1-51P01701 117 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CD7P09564 240 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GALR1P47211 349 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB5CP51148 216 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R45P59539 299 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-11P60412 298 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BLOC1S1P78537 153 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC8Q13216 396 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TOR2AQ5JU69 321 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CLLU1Q5K131 121 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CST9LP1Q5W188 147 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DCANP1Q8TF63 244 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MARC2Q969Z3 335 aa4.5□□□□□ -1.69
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