RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 AKR1C1Q04828 323 aa14.82□□□□□ -0.04
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.72□□□□□ -0.05
CAPNS1-205ENST00000588780 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 SYNGR2O43760 224 aa14.67□□□□□ -0.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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