RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-208ENST00000587775 RNF141Q8WVD5 230 aa6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 CITED4Q96RK1 184 aa6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 OR51M1Q9H341 326 aa6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 RNF24Q9Y225 148 aa6.79□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 CD7P09564 240 aa6.78□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.78□□□□□ -1.32
TMUB2-208ENST00000587775 S100A7P31151 101 aa6.78□□□□□ -1.32
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TMUB2-208ENST00000587775 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.75□□□□□ -1.33
TMUB2-208ENST00000587775 OR4C46A6NHA9 309 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMUB2-208ENST00000587775 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMUB2-208ENST00000587775 IGLV2-11P01706 119 aa6.73□□□□□ -1.33
TMUB2-208ENST00000587775 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMUB2-208ENST00000587775 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMUB2-208ENST00000587775 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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TMUB2-208ENST00000587775 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMUB2-208ENST00000587775 BLOC1S1P78537 153 aa6.73□□□□□ -1.33
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