RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ZMAT4	Q9H898	229 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	RPRM	Q9NS64	109 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	BCL2L11	O43521	198 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	C1QB	P02746	253 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	IGLC2	P0DOY2	106 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF738	Q8NE65	137 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	BLNK	Q8WV28	456 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf173	Q96LM9	149 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229		H3BQ15	152 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	TAS2R45	P59539	299 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	KHDC3L	Q587J8	217 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	TMUB2	Q71RG4	321 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	PAXX	Q9BUH6	204 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	HRH4	Q9H3N8	390 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC17A3	O00476	420 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR10J4	P0C629	311 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-DMB	P28068	263 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	SERF2	P84101	59 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	CD300C	Q08708	224 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	GUK1	Q16774	197 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR51M1	Q9H341	326 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV3-20	P01619	116 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	MB	P02144	154 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA25	Q9BR10	227 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	RETN	Q9HD89	108 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229		F6UB75	175 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP69	Q49AA0	526 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	HYLS1	Q96M11	299 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	SPP1	P10451	314 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-DRB4	P13762	266 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	PSG3	Q16557	428 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	RNF141	Q8WVD5	230 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	CSTL1	Q9H114	145 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB135	Q30KP9	77 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229		H3BMM0	161 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	PSG9	Q00887	426 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	FXYD5	Q96DB9	178 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	RCHY1	Q96PM5	261 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0J9YX75	114 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2C	O00762	179 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	RAB24	Q969Q5	203 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229		U3KQK5	164 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF253	O75346	499 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	PDE6H	Q13956	83 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF503	Q96F45	646 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	TG	P01266	2768 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	FXYD7	P58549	80 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		18.31	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms