RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561526.5

SNAP23-204, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-204	ENST00000561526	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	DOK5	Q9P104	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	HSPG2	P98160	4391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526		A0A087X0K7	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CENPX	A8MT69	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	IL5	P05113	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	LINC00869	P0C866	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CXCL3	P19876	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	S100A7	P31151	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	INPP1	P49441	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	EMP1	P54849	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	OXA1L	Q15070	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	LYRM1	O43325	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	HBE1	P02100	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	TCRB	P04435	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	PRM2	P04554	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	IL15RA	Q13261	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CT83	Q5H943	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526		M0R2Z0	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	AGPAT2	O15120	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	OR5G3	P0C626	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526		P0DMU3	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	CXCL2	P19875	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	TSPO	P30536	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RAP2B	P61225	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	PSG3	Q16557	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	MGST2	Q99735	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-204	ENST00000561526	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526		A0A1B0GVY2	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	CCS	O14618	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	RTL8C	O15255	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	INS	P01308	110 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	AZU1	P20160	251 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	B2M	P61769	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	FGL1	Q08830	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-204	ENST00000561526		Q6ZR54	194 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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