RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	CGB1	A6NKQ9	187 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	GABARAP	H6UMI1	98 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SIVA1	O15304	175 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	XRCC3	O43542	346 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	FCGR3B	O75015	233 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TUSC2	O75896	110 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	LY6G6C	O95867	125 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	MYOD1	P15172	320 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	AZU1	P20160	251 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TCTA	P57738	103 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	KLK9	Q2XQG4	91 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920		Q6ZS49	121 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	GPHB5	Q86YW7	130 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	MMD2	Q8IY49	270 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SPIN2A	Q99865	258 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920		V9GY05	133 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920		A0A0J9YWU9	116 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ARL6IP5	O75915	188 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	NDUFB6	O95139	128 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TAS2R30	P59541	319 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	PAFAH1B2	P68402	229 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SRPX	P78539	464 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ELOB	Q15370	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	CST9LP1	Q5W188	147 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920		E5RGE8	158 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ACTL6B	O94805	426 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	KBTBD11	O94819	623 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	REG1A	P05451	166 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	C8orf88	P0DMB2	117 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	ATP6V0C	P27449	155 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	DHRS2	Q13268	280 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	RAB32	Q13637	225 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	BTNL8	Q6UX41	500 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	GPR82	Q96P67	336 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-211	ENST00000553920	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	NUDT3	O95989	172 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	IFNA1	P01562	189 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	TRGC2	P03986	189 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	ELK1	P19419	428 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	TFPI2	P48307	235 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	SULT1A2	P50226	295 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	RND2	P52198	227 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	ARFRP1	Q13795	201 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-211	ENST00000553920	FRZB	Q92765	325 aa		6.02	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms