RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.86□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 LGI3Q8N145 548 aa4.86□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF709Q8N972 641 aa4.86□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 OR52E5Q8NH55 327 aa4.86□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 DTD1Q8TEA8 209 aa4.86□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.86□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 GPR132Q9UNW8 380 aa4.86□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.86□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.86□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 SOCS3O14543 225 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 PFDN1O60925 122 aa4.85□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 SMIM29Q86T20 159 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 OR1S1Q8NH92 325 aa4.85□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.85□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 C17orf77Q96MU5 243 aa4.85□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC25A22Q9H936 323 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 V9GYH0 126 aa4.85□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 H3BP45 60 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 P0DMU3 169 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM231AP0DMU4 169 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM231CP0DMU5 169 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 ASAH1Q13510 395 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 SMCO1Q147U7 214 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 FCN2Q15485 313 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.84□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.84□□□□□ -1.63
GNPTAB-209ENST00000552009 RNF182Q8N6D2 247 aa4.84□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 SRRQ9GZT4 340 aa4.84□□□□□ -1.63
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GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 M0R2Z0 102 aa4.83□□□□□ -1.64
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GNPTAB-209ENST00000552009 PSMB3P49720 205 aa4.83□□□□□ -1.64
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GNPTAB-209ENST00000552009 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.83□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.83□□□□□ -1.64
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GNPTAB-209ENST00000552009 RSG1Q9BU20 258 aa4.83□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.83□□□□□ -1.64
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GNPTAB-209ENST00000552009 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 WRBO00258 174 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 IFNA21P01568 189 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 HBE1P02100 147 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 DEFB130BP0DP73 79 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 DEFB130AP0DP74 79 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 IL7P13232 177 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 ORM2P19652 201 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 AZU1P20160 251 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 ID1P41134 155 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 BCAP31P51572 246 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 AP3S2P59780 193 aa4.82□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 PSG9Q00887 426 aa4.82□□□□□ -1.64
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