RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		A0A087WSZ3	146 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM238	C9JI98	176 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PPP5D1	E7EU14	171 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PIAS1	O75925	651 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ATG12	O94817	140 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	APOA2	P02652	100 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CRH	P06850	196 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R2	P41236	205 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DR1	Q01658	176 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SNCB	Q16143	134 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	STX19	Q8N4C7	294 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LYSMD1	Q96S90	227 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	BIN3	Q9NQY0	253 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GID8	Q9NWU2	228 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PRND	Q9UKY0	176 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SSR3	Q9UNL2	185 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ROCK1	Q13464	1354 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NCAPD3	P42695	1498 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		K7ERJ3	54 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PPY	P01298	95 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	C1QB	P02746	253 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	FABP1	P07148	127 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CXCL1	P09341	107 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR10J4	P0C629	311 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IDO1	P14902	403 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	COX7C	P15954	63 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	G0S2	P27469	103 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GNG10	P50151	68 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GNG5	P63218	68 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LYG2	Q86SG7	212 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CROCCP2	Q86T23	111 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NUP35	Q8NFH5	326 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PSMF1	Q92530	271 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GV72	72 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ODAM	A1E959	279 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		H3BQV1	296 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IFNA21	P01568	189 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IFNA14	P01570	189 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IGLV3-1	P01715	115 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SERPINB1	P30740	379 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	RAB5C	P51148	216 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TMBIM6	P55061	237 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ARPP19	P56211	112 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TAS2R41	P59536	307 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	B2M	P61769	119 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GNG3	P63215	75 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PATE2	Q6UY27	113 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00575	Q6W349	94 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR5AS1	Q8N127	324 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PPTC7	Q8NI37	304 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ISOC1	Q96CN7	298 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GINS3	Q9BRX5	216 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC32	Q9BV29	185 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DDA1	Q9BW61	102 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SPANXC	Q9NY87	97 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TET1	Q8NFU7	2136 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125		E7EQ34	232 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	FAM107A	O95990	144 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	IGLV1-51	P01701	117 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	INSL3	P51460	131 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	CRYBA4	P53673	196 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	KLRD1	Q13241	179 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC18	Q8N456	261 aa		0.52	□□□□□ -2.33

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