RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-214ENST00000543184 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.29□□□□□ -0.6
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PRAME-214ENST00000543184 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.29□□□□□ -0.6
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PRAME-214ENST00000543184 ST20Q9HBF5 79 aa11.29□□□□□ -0.6
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PRAME-214ENST00000543184 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.62e-36■■□□□ 13
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PRAME-214ENST00000543184 Q86TA4 180 aa11.27□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.24□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.24□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 FAM231BA6NCW3 169 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 ZNF747Q9BV97 191 aa11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 A0A1B0GUT8 65 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 FA2HQ7L5A8 372 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-214ENST00000543184 C17orf100A8MU93 164 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 D6R8Y8 96 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 CRYGCP07315 174 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 PET117Q6UWS5 81 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 JMJD8Q96S16 334 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 TRGV9Q99603 122 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-214ENST00000543184 A0A096LNJ9 63 aa11.22□□□□□ -0.61
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