RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777		H3BRN7	92 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	B2M	P61769	119 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	MUC4	Q99102	2169 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	GOSR2	O14653	212 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RAP2B	P61225	183 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ID3	Q02535	119 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	IL15RA	Q13261	267 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	AZU1	P20160	251 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SSSCA1	O60232	199 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	HYPM	O75409	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	OR5G3	P0C626	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	TSPO	P30536	169 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	H2BFS	P57053	126 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RHOB	P62745	196 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01587	Q99440	93 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777		F5H768	121 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SSNA1	O43805	119 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	CCNK	O75909	580 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00869	P0C866	280 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	CXCL3	P19876	107 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PLP1	P60201	277 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SELENOT	P62341	195 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	FCN2	Q15485	313 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087X0K7	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777		K7EPK0	472 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	RAB32	Q13637	225 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PSG3	Q16557	428 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	NUDT3	O95989	172 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5G1	P05496	136 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	HTN1	P15515	57 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5G3	P48201	142 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R60	P59551	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	DLK1	P80370	383 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CBY3	A6NI87	242 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777		H0YIZ8	118 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	S100A10	P60903	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CDKN1B	P46527	198 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CCL18	P55774	89 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TNP2	Q05952	138 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	RYR1	P21817	5038 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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