RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-218	ENST00000525459	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	DEFB131A	P59861	70 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	PSG9	Q00887	426 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	PYY	P10082	97 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	RAB5C	P51148	216 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459		H3BQ15	152 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-218	ENST00000525459	CXorf1	O96002	111 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	OR10J4	P0C629	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SLC17A3	O00476	420 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	PSG3	Q16557	428 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	STH	Q8IWL8	128 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SULT1A2	P50226	295 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459		H3BTX0	84 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	NDUFB4	O95168	129 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	GCHFR	P30047	84 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	APOC4	P55056	127 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	AGRN	O00468	2067 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-218	ENST00000525459	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459		A0A0J9YX75	114 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF124	Q15973	351 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	FHIT	P49789	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRK-218	ENST00000525459	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.81	□□□□□ -0.2

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