RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPB3Q92617 1050 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NABP2Q9BQ15 211 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 RBP4P02753 201 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R45P59539 299 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PRCDQ00LT1 54 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CR1LQ2VPA4 569 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TIGITQ495A1 244 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PRR31Q5SQ13 230 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPM0 123 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 A1L4Q6 167 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 F8W1H4 67 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1D-33P01593 117 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-33P01594 117 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5G2Q06055 141 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 JMJD8Q96S16 334 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 DPM3Q9P2X0 92 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 KALRNO60229 2985 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB4O95168 129 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 RNF125Q96EQ8 232 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 KCNS1Q96KK3 526 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 VWC2LB2RUY7 222 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 F5H768 121 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM23O14925 209 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 GPR183P32249 361 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF726P1Q15940 193 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TEX29Q8N6K0 151 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 LRBAP50851 2863 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM250H0YL14 139 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf1O96002 111 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MOSP00540 346 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NTF3P20783 257 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 DDB2Q92466 427 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PMCHP20382 165 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CNTFRP26992 372 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MGST2Q99735 147 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 S4R3C0 116 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CRYBB3P26998 211 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5G3P48201 142 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PS18 150 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 P0C879 139 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 LYZP61626 148 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CFHR4Q92496 578 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TM2D2Q9BX73 214 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TACC2O95359 2948 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MT-ATP8P03928 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZUT4 128 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.28□□□□□ -1.4
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