RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ADAP1O75689 374 aa12.57□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.57□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PSENENQ9NZ42 101 aa12.57□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 V9GYH0 126 aa12.57□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 SELENOTP62341 195 aa12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PATE2Q6UY27 113 aa12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 DEDD2Q8WXF8 326 aa12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 CCNKO75909 580 aa12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 CDKN1BP46527 198 aa12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 CLINT1Q14677 625 aa12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 SSX7Q7RTT5 188 aa12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ARL6Q9H0F7 186 aa12.55□□□□□ -0.4
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ITGA3-215ENST00000515147 SSSCA1O60232 199 aa12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 SMIM8Q96KF7 97 aa12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ARV1Q9H2C2 271 aa12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 Q9H8V8 135 aa12.54□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 C9orf170A2RU37 121 aa12.53□□□□□ -0.4
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ITGA3-215ENST00000515147 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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ITGA3-215ENST00000515147 KIR3DS1Q14943 382 aa12.53□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.53□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 S100A7AQ86SG5 101 aa12.53□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.53□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 H7BYZ3 331 aa12.52□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 OR5I1Q13606 314 aa12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.52□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 FNDC10F2Z333 226 aa12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 CXCL2P19875 107 aa12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TEPPQ6URK8 271 aa12.51□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 OR10J6PQ8NGY7 276 aa12.51□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 RNF24Q9Y225 148 aa12.51□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 A0A0J9YY99 117 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 PRAC2D3DTV9 90 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GOSR2O14653 212 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 M6PRP20645 277 aa12.49□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 S100A5P33763 92 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GFI1BQ5VTD9 330 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC190Q86UF4 302 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF503Q96F45 646 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 Q9H3A6 140 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 MGAT4CQ9UBM8 478 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.49□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 H3BTX0 84 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 SLC17A3O00476 420 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 AGPAT2O15120 278 aa12.48□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 OR4E1P0C645 316 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 ARL16Q0P5N6 197 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TTC32Q5I0X7 151 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 MORN5Q5VZ52 161 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF546Q86UE3 836 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.48□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC28AQ8IWP9 274 aa12.48□□□□□ -0.41
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ITGA3-215ENST00000515147 TSC22D2O75157 780 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GAGE7O76087 117 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 SCGB1D2O95969 90 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GAGE12FP0CL80 117 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GAGE12GP0CL81 117 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 GAGE12IP0CL82 117 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TAS2R30P59541 319 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 ESRGQ1W209 222 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM37Q8WXS4 190 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 UPK3BQ9BT76 320 aa12.47□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 RLN2P04090 185 aa12.46□□□□□ -0.41
ITGA3-215ENST00000515147 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
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