RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	HBD	P02042	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	EVI2A	P22794	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	FRYL	O94915	3013 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A0G2JLM5	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDKN1B	P46527	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RITA1	Q96K30	269 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	C22orf46	C9J442	243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMIM13	P0DJ93	91 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q8TAT8	98 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAX1BP3	O14907	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	LHB	P01229	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	BMI1	P35226	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	FOXC2	Q99958	501 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MFAP4	P55083	255 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEACAM3	P40198	252 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	LEP	P41159	167 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATRX	P46100	2492 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63	2e-6	■■□□□ 13.8
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CGB3	P0DN86	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CGB7	P0DN87	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	GATA4	P43694	442 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBX1	P62877	108 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CT83	Q5H943	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	COX8A	P10176	69 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q6AWC8	147 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		11.08	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	LTA	P01374	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	SAP30	O75446	220 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	HSD52	Q0P140	79 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	CR1L	Q2VPA4	569 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBD6	Q96DN6	1003 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H4G	Q99525	98 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A1B0GW15	77 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIMM23	O14925	209 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705		K7EM74	188 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	DSCAM	O60469	2012 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	VWC2L	B2RUY7	222 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSG3	Q16557	428 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	HAX1	O00165	279 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEACAM4	O75871	244 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACACB	O00763	2458 aa		11.06	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms