RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 NF1P21359 2839 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 C8GP07360 202 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 APC2O95996 2303 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMA4Q16363 1823 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0D9SEW6 157 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL5CA6NH57 179 aa3.43□□□□□ -1.86
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PGGT1B-205ENST00000514178 CCL16O15467 120 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM27BQ5VT28 67 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 AP3S1Q92572 193 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.42□□□□□ -1.86
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PGGT1B-205ENST00000514178 ITPR2Q14571 2701 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SULT1B1O43704 296 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SMIM17P0DL12 118 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
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PGGT1B-205ENST00000514178 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DOHHQ9BU89 302 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MTORP42345 2549 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 G6PCP35575 357 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DNHD1Q96M86 4753 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-205ENST00000514178 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 HMSDA8MTL9 139 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2J2O76002 312 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 ARPP19P56211 112 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 ATMQ13315 3056 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TERB2Q8NHR7 220 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 LXNQ9BS40 222 aa3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1B-205ENST00000514178 FXYD2P54710 66 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 AQP4P55087 323 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42P60953 191 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 RELAQ04206 551 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6Q795 121 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINB9P50453 376 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 DCANP1Q8TF63 244 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
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PGGT1B-205ENST00000514178 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.37□□□□□ -1.87
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PGGT1B-205ENST00000514178 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 PFN4Q8NHR9 129 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM106AQ96A25 262 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf50Q96LR7 162 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-205ENST00000514178 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.37□□□□□ -1.87
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