RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 MBP02144 154 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 C4BPBP20851 252 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMB3P49720 205 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 TAS2R45P59539 299 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.96□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 KNCNA6PVL3 124 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10J4P0C629 311 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 PYYP10082 97 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 SERF2P84101 59 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 KHDC3LQ587J8 217 aa9.95□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 LCN15Q6UWW0 184 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 STHQ8IWL8 128 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF182Q8N6D2 247 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF738Q8NE65 137 aa9.95□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087X0K7 114 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 C17orf77Q96MU5 243 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51M1Q9H341 326 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 RPRMQ9NS64 109 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BQ15 152 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 SOCS3O14543 225 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV3-20P01619 116 aa9.93□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC17A3O00476 420 aa9.92□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf173Q96LM9 149 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 B9D2Q9BPU9 175 aa9.92□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.92□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 A8MZ25 164 aa9.91□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-DMBP28068 263 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 PSG9Q00887 426 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 TMED6Q8WW62 240 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB24Q969Q5 203 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 COL7A1Q02388 2944 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 HAGHQ16775 308 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1B-204ENST00000503638 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 FXYD5Q96DB9 178 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC11BP0C7V7 166 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 RANP62826 216 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC51BQ86UW2 128 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZMAT4Q9H898 229 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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