RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	PAGE4	O60829	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	M6PR	P20645	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GALR1	P47211	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR5I1	Q13606	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR2F1	Q13607	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	MEF2D	Q14814	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TWIST1	Q15672	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ESRG	Q1W209	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	FABP1	P07148	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	HTN1	P15515	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TAS2R60	P59551	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	HAMP	P81172	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NEDD8	Q15843	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LINC01587	Q99440	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ADAP1	O75689	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GABARAP	O95166	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NDUFB4	O95168	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CDS2	O95674	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	IFNA5	P01569	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	APOA1	P02647	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CD3D	P04234	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RHOB	P62745	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	FGL1	Q08830	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GAMT	Q14353	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LGI3	Q8N145	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426		U3KQ87	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		H3BNG1	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SIVA1	O15304	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE7	O76087	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TBP	P20226	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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