RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PATE2Q6UY27 113 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ARPC1AQ92747 370 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0BQ99437 205 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LOXL3P58215 753 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 OR1L8Q8NGR8 309 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FXYD5Q96DB9 178 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-46P01743 117 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5G2Q06055 141 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RNF7Q9UBF6 113 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 H3BMG7 143 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CCL3L1P16619 93 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DLX1P56177 255 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FXYD2P54710 66 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DKK2Q9UBU2 259 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 E7EUB6 86 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FAM169BQ8N8A8 192 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 AMN1Q8IY45 258 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRELID3AQ96N28 172 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RBP4P02753 201 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TCRAP04437 139 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CD40P25942 277 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.97□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PSMB11A5LHX3 300 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A6P0DMU7 189 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A5P0DMU8 189 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A10P0DMU9 189 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A7P0DMV0 189 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM213A2RRL7 107 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CKS2P33552 79 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GWB2 263 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LTAP01374 205 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf83Q53S99 150 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM222BQ8WU58 562 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FNDC10F2Z333 226 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OR4X2Q8NGF9 303 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OR10X1Q8NGY0 326 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 INSIG2Q9Y5U4 225 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZS92 163 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM160Q9NX00 188 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C22orf46C9J442 243 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 BSPH1Q075Z2 132 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GAFA1Q96PS6 74 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 VGLL1Q99990 258 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JNJ9 132 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PRRG2O14669 202 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CRYBA4P53673 196 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FOXC1Q12948 553 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GFRALQ6UXV0 394 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DDB2Q92466 427 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FMC1Q96HJ9 113 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF479Q96JC4 524 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 Q9UFV3 132 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 WT1-ASQ06250 92 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.93□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TWIST1Q15672 202 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 S4R3C0 116 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF1AP19438 455 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HBDP02042 147 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TCF15Q12870 199 aa12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZZEF1O43149 2961 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 M0R3E3 92 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LHBP01229 141 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 INSL3P51460 131 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF714Q96N38 554 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H4GQ99525 98 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 BSNQ9UPA5 3926 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf97H3BN30 126 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM4O75871 244 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.8 ms