RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477949.1

USP33-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, human

TSL 2

Gene USP33, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP33-208	ENST00000477949	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	FABP5	Q01469	135 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		A0A0U1RQV1	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	LECT2	O14960	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SLC25A4	P12235	298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	RAB3B	P20337	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	MEOX2	P50222	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	GNG2	P59768	71 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		Q9HAA7	133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		A0A0A6YYH2	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		A6NJ64	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PRAF2	O60831	178 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	GNAO1	P09471	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	CDKN1B	P46527	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	MGLL	Q99685	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.1	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		A0A0J9YXV3	536 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PANO1	I0J062	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949		K7EQD1	137 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	GPR31	O00270	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	HTR2B	P41595	481 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	HERV-K104	P61576	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ZNF90	Q03938	601 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	GAMT	Q14353	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	LAGE3	Q14657	143 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PSG3	Q16557	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	VGLL1	Q99990	258 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP33-208	ENST00000477949	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	SPINK4	O60575	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	CBX5	P45973	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	OR2F1	Q13607	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	CXCL3	P19876	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP33-208	ENST00000477949	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76

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