RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 AGPAT2O15120 278 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 TCRBP04435 133 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 PRM2P04554 102 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 CXCL3P19876 107 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 RNF24Q9Y225 148 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 DNAH17Q9UFH2 4485 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 A0A087X0K7 114 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 K7EPK0 472 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 M0R2N4 97 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 CRXO43186 299 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 COX7A2P2O60397 106 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 LINC00305Q7Z4B0 112 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 GGACTQ9BVM4 153 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 NUDT15Q9NV35 164 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 CAV2P51636 162 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 PSG3Q16557 428 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 FAM210BQ96KR6 192 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 OXA1LQ15070 435 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 MGST2Q99735 147 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 HERC2O95714 4834 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 CST7O76096 145 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 HTN1P15515 57 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 LINC01587Q99440 93 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-204ENST00000468807 H3BTX0 84 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 CAMLGP49069 296 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 S100A10P60903 97 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 B2MP61769 119 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 RAB31Q13636 194 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 C10orf113Q5VZT2 155 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 LCN15Q6UWW0 184 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 DEFB130BP0DP73 79 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 DEFB130AP0DP74 79 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 CXCL2P19875 107 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 C2orf50Q96LR7 162 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 LYRM9A8MSI8 78 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 AZU1P20160 251 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 MORN5Q5VZ52 161 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 Q6ZRG5 221 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 OPCMLQ14982 345 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 FCN2Q15485 313 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 MIC13Q5XKP0 118 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 CCDC32Q9BV29 185 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.42■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1109Q2LD37 5005 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 CDKN1BP46527 198 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 PKHD1P08F94 4074 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 SLC17A3O00476 420 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 TSPOP30536 169 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 BAXQ07812 192 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.4■□□□□ 0.06
TTC28-204ENST00000468807 TRAV5A0A0B4J249 113 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 F5H768 121 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 TAS2R60P59551 318 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 RAB32Q13637 225 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 STX12Q86Y82 276 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.39■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 PRAC2D3DTV9 90 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 IGLC2P0DOY2 106 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 SULT1A1P50225 295 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 C16orf74Q96GX8 76 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 IGSF23A1L1A6 192 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 H3BQ15 152 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 S100A11P31949 105 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 HBG1P69891 147 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 HBG2P69892 147 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-204ENST00000468807 LGALS9BQ3B8N2 356 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms