RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 IL7P13232 177 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 DSTNP60981 165 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 RAB8AP61006 207 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 CXCR4P61073 352 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 FABP9Q0Z7S8 132 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 C5orf17Q8NAS9 161 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 OR51D1Q8NGF3 324 aa-1.43□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 PIGXQ8TBF5 258 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 AGR3Q8TD06 166 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 MCUR1Q96AQ8 359 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 C19orf60Q96EN9 201 aa-1.43□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 HIST1H2BLQ99880 126 aa-1.43□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 MS4A6AQ9H2W1 248 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 FBXL12Q9NXK8 326 aa-1.43□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 C3orf18Q9UK00 162 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 ARL5AQ9Y689 179 aa-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 DAPL1A0PJW8 107 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 F5H5K5 113 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 K7ERJ3 54 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 PIAS1O75925 651 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 TNFAIP8O95379 198 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 SERPINE1P05121 402 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 RD3LP0DJH9 198 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 RSU1Q15404 277 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 HLA-DRB5Q30154 266 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 C5orf46Q6UWT4 87 aa-1.44□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 COMMD7Q86VX2 200 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 LINC00269Q8N2A0 174 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM126AQ9H061 195 aa-1.45□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
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