RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		A0A1W2PRE2	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		H3BQ15	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SOCS3	O14543	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NDUFB4	O95168	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PYY	P10082	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	BMI1	P35226	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PPT1	P50897	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MLX	Q9UH92	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	AGRN	O00468	2067 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	HELT	A6NFD8	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	OR7C2	O60412	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	GALR1	P47211	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613		M0QZ24	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	SLC17A3	O00476	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	TSPAN4	O14817	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	OR10J4	P0C629	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	BCL2	P10415	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	INSL3	P51460	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	CD81	P60033	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	ICAM4	Q14773	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613		K7EQG2	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	ISLR	O14498	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	PAGE4	O60829	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	IFNA1	P01562	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	PF4	P02776	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	PSG9	Q00887	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	RARRES2	Q99969	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-208	ENST00000467613	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms