RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466346.1

MRPL23-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 2

Gene MRPL23, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-208	ENST00000466346	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PDE6H	Q13956	83 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF253	O75346	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PYY	P10082	97 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346		H3BQ15	152 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	OR10J4	P0C629	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PSG9	Q00887	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	SLC17A3	O00476	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	CXorf1	O96002	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	STH	Q8IWL8	128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346		H3BTX0	84 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	APOC4	P55056	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RAB5C	P51148	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF124	Q15973	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	PSG3	Q16557	428 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	NDUFB4	O95168	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	GCHFR	P30047	84 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	AGRN	O00468	2067 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MRPL23-208	ENST00000466346		A0A0J9YX75	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms