RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 NME2P1O60361 137 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SNNO75324 88 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CST3P01034 146 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FTLP02792 175 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CST2P09228 141 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 OR5AC1P0C628 307 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 OR13C7P0DN81 318 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PSMC3P17980 439 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 DCKP27707 260 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINA4P29622 427 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FCER1GP30273 86 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MPIP34949 423 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SLC1A3P43003 542 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 RAB8AP61006 207 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MPP1Q00013 466 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IQCB1Q15051 598 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TOMM20Q15388 145 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 RSU1Q15404 277 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 BCL7AQ4VC05 210 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TAF7LQ5H9L4 462 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SAMD13Q5VXD3 122 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PTCHD4Q6ZW05 846 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD46Q86W74 232 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 OR13C2Q8NGS9 318 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CPLX3Q8WVH0 158 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CYGBQ8WWM9 190 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PIGCQ92535 297 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PTP4A1Q93096 173 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ARL5BQ96KC2 179 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SFXN2Q96NB2 322 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 WFDC6Q9BQY6 131 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 UQCC2Q9BRT2 126 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PRADC1Q9BSG0 188 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 VCPKMTQ9H867 229 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 RMND1Q9NWS8 449 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 COPS7AQ9UBW8 275 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINA10Q9UK55 444 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 A0A0A6YYD5 115 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FABP12A6NFH5 140 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 LRRN3E7EW58 273 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 H3BUT2 72 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V0E1O15342 81 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CYTH3O43739 400 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 HSF2BPO75031 334 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CCNB2O95067 398 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf105O95561 183 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PPYP01298 95 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 S100A8P05109 93 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SERPIND1P05546 499 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MYL1P05976 194 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CYBAP13498 195 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ARL4AP40617 200 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CD86P42081 329 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA5P43359 124 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FHITP49789 147 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PRKAG1P54619 331 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TAS2R41P59536 307 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CD47Q08722 323 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 XRCC4Q13426 336 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CBFBQ13951 182 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IL18Q14116 193 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf113Q5VZT2 155 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ADALQ6DHV7 355 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D21Q8IYX1 336 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IGSF22Q8N9C0 903 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ATL1Q8WXF7 558 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PTH2Q96A98 100 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ROPN1LQ96C74 230 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CRB3Q9BUF7 120 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MND1Q9BWT6 205 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ARL6Q9H0F7 186 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 REEP4Q9H6H4 257 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TIGARQ9NQ88 270 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CLN6Q9NWW5 311 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MARCH5Q9NX47 278 aa-2.88□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SAMD15Q9P1V8 674 aa-2.88□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms